Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms