Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc166S4R181 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms