Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W9

Gria3, Glutamate receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria3Q9Z2W9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gria3Q9Z2W9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gria3Q9Z2W9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms