Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Robo3Q9Z2I4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Robo3Q9Z2I4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms