Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mbd3Q9Z2D8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms