Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn6Q9Z262 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cldn6Q9Z262 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms