Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cldn7Q9Z261 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn7Q9Z261 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms