Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn8Q9Z260 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms