Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ap3b1Q9Z1T1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms