Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddx39bQ9Z1N5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms