Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf1Q9Z1B8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf1Q9Z1B8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms