Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cpne6Q9Z140 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cpne6Q9Z140 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms