Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ror1Q9Z139 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms