Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Cdh20Q9Z0M3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Cdh20Q9Z0M3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cdh20Q9Z0M3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh20Q9Z0M3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cdh20Q9Z0M3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms