Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gipc1Q9Z0G0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gipc1Q9Z0G0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms