Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbp2Q9Z0E6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms