Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pmfbp1Q9WVQ0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms