Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PapolbQ9WVP6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms