Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap4s1Q9WVL1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap4s1Q9WVL1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms