Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp18Q9WTV6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp18Q9WTV6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp18Q9WTV6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Usp18Q9WTV6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp18Q9WTV6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp18Q9WTV6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp18Q9WTV6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp18Q9WTV6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Usp18Q9WTV6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp18Q9WTV6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms