Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R2

Trim3, Tripartite motif-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim3Q9R1R2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim3Q9R1R2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms