Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhx6Q9R1R0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhx6Q9R1R0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms