Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Taf7Q9R1C0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Taf7Q9R1C0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Taf7Q9R1C0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Taf7Q9R1C0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Taf7Q9R1C0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf7Q9R1C0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Taf7Q9R1C0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Taf7Q9R1C0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf7Q9R1C0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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Taf7Q9R1C0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf7Q9R1C0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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