Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Htra1Q9R118 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Htra1Q9R118 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms