Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Y8

Gabrg1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg1Q9R0Y8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabrg1Q9R0Y8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms