Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NrkQ9R0G8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NrkQ9R0G8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms