Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Plod3Q9R0E1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Plod3Q9R0E1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms