Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Wdr54Q9R0D8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Wdr54Q9R0D8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms