Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lamc3Q9R0B6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lamc3Q9R0B6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lamc3Q9R0B6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms