Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AmfrQ9R049 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms