Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CtsjQ9R014 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms