Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf4Q9QZS2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf4Q9QZS2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms