Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col4a3Q9QZS0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col4a3Q9QZS0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms