Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ercc4Q9QZD4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms