Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ubxn8Q9QZ49 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ubxn8Q9QZ49 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms