Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndrg3Q9QYF9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndrg3Q9QYF9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms