Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VapbQ9QY76 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms