Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tspan3Q9QY33 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms