Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pkp3Q9QY23 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms