Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpsf3Q9QXK7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf3Q9QXK7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms