Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Copg2Q9QXK3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Copg2Q9QXK3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms