Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trpc5Q9QX29 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trpc5Q9QX29 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms