Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Homer2Q9QWW1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms