Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krt17Q9QWL7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krt17Q9QWL7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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