Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rai2Q9QVY8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rai2Q9QVY8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms