Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dkk3Q9QUN9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dkk3Q9QUN9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms