Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoaQ9QUI0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms