Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfmbt1Q9JMD1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sfmbt1Q9JMD1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms