Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gkap1Q9JMB0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gkap1Q9JMB0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms