Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Tgm1Q9JLF6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Tgm1Q9JLF6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tgm1Q9JLF6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Tgm1Q9JLF6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm1Q9JLF6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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